تحدث نوباتُ الصداع العنقودي على شكل دورات. وتستمر النوبةُ من ساعة واحدة إلى ثلاث ساعات عادةً. وقد يتراوح تكرارُ حدوث النوبات من نوبة واحدة كل عدة أيام إلى عدة نوبات في اليوم الواحد. وقد تستمر دورة الصداع العنقودي فترة تتراوح من عدة أسابيع إلى عدة أشهر.