قد يسبب داءُ كرون التهاباً في أي جزء من الجهاز الهضمي، من الفم إلى الشرج. ويصيب هذا المرضُ عادةً القولون والجزء الأخير من الأمعاء الدقيقة الذي يُسمى اللفائفي.