عندما يتعامل الجهاز المناعي مع خلايا الجسم على أنها مادة غريبة، تحدث أمراضٌ نسميها "أمراض المناعة الذاتية". والذئبة أحد أمراض المناعة الذاتية. إن الأضداد التي تساهم في داء الذئبة تدعى الأضداد الذاتية. تهاجم هذه الأضداد الذاتية الجسم نفسه.