في زهري المرحلة المتأخرة، سوف تتلف البكتيريا القلب أو العينين أو الدماغ أو العظام أو أي جزء آخر من الجسم تقريباً. قد يحدث التلف بعد المرحلة الأولية بسنوات أو حتى بعقُود.